小陰莖(micropenis)是指陰莖外觀正常長度與直徑比值正常，但陰莖體的長度小於正常陰莖長度平均值2.5個標準差以上。陰莖的長度是指用手提陰莖頭盡量拉直即相當於陰莖充分勃起時從陰莖頂到恥骨聯合的距離。成人一般以陰莖鬆弛長度不足3cm則為陰莖過短。
造成小陰莖的原因可能因為：
1.促進性腺激素分泌不足的性腺功能减退。
2.促進性腺激素分泌過多的性腺功能减退。
3.原發性(先天性無特殊疾病原因導致的)小陰莖。
造成小陰莖的因素眾多，治療上需先找出病因，也可使用藥物來調整人體內分泌，以改善症狀。
